理化学研究所(理研)生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA(クロマチン[1] )の相互作用をゲノム全体で調べる ...
皆さんは日々増加するRNA-seqデータの解析に、どのようなツールを使っていますか? 従来のツールでは複数サンプルを同時に分析する際に精度や効率の問題を抱えていませんか? 本記事では、機械学習を活用した次世代RNA-seqアセンブラー「Aletsch(アレッチ ...
前回は、ニワトリのゲノムをバックボーンとして取得し、染色体リネームを行いました。今回は、RNA-seqシミュレーションについて、その理論的背景と面白さを紹介します。 RNA-seq解析を学ぶには、実際のデータが必要です。しかし、実験データを取得するの ...