現時点ではEclipseに枯れたバージョン2.1を使う Eclipseでiアプリを開発するためのDoJaプラグインは、Eclipse 2.1.1に対応しています。2.1系列の最新版である2.1.3でも問題なく利用できるので、新たにインストールする場合はこちらを使った方がよいでしょう。

Which Java IDE is best? Compare IntelliJ IDEA , Eclipse, and NetBeans for features, usability, and compatibility with your favorite tools and frameworks. Every Java programmer needs a programming ...