conda install ipython pip install pandas tqdm matplotlib opencv-python seaborn scikit-learn umap-learn hdbscan Step 4: Clone B-SOID and change your current directory ...
In the cell-type annotation task, the fine-tuned scGPT predicts cell-type labels for query set as inference. The model performance is evaluated on standard classificaton metrics. Here we visualize the ...
UMAP (Uniform Manifold Approximation and Projection) は、高次元データを低次元空間に圧縮し、データの構造を視覚的に表現するための強力な手法です。UMAPに入力するためには、データは数値のベクトル形式である必要があります。 一方、画像は通常、ピクセルの集合と ...
t-SNEやUMAPは、データ可視化の分野で非常に人気のある手法であり、最近の研究や技術の進展により、これらの手法はさらに改善されています。以下に、これらの手法の最近の動向と主流の改善点について説明します。 t-SNEとUMAPの改善点 計算効率の向上: t-SNE ...